Вирусы
<<  Вирус ветряной оспы/опоясывающего лишая VZV Социальный проект Акция «Вирус сквернословия  >>
Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia
Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia
Лайм-боррелиоз
Лайм-боррелиоз
Вирусный клещевой энцефалит
Вирусный клещевой энцефалит
Принцип метода ПЦР
Принцип метода ПЦР
Температурный режим:
Температурный режим:
Температурный режим:
Температурный режим:
Проверка специфичности системы для детекции Ehrlichia spp
Проверка специфичности системы для детекции Ehrlichia spp
Схема детекции результатов методом TaqMan
Схема детекции результатов методом TaqMan
Пример графиков накопления продуктов амплификации
Пример графиков накопления продуктов амплификации
Секвенирование ДНК
Секвенирование ДНК
Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia
Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia
Проверка чувствительности тест-системы методом «конечных разведений»
Проверка чувствительности тест-системы методом «конечных разведений»
Для статистической обработки полученных результатов исползовалась
Для статистической обработки полученных результатов исползовалась
Постановка реакции секвенирования
Постановка реакции секвенирования
Электрофорез ДНК в агарозном геле
Электрофорез ДНК в агарозном геле
Картинки из презентации «Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp» к уроку медицины на тему «Вирусы»

Автор: Илья Флямер. Чтобы познакомиться с картинкой полного размера, нажмите на её эскиз. Чтобы можно было использовать все картинки для урока медицины, скачайте бесплатно презентацию «Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp.ppt» со всеми картинками в zip-архиве размером 1571 КБ.

Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp

содержание презентации «Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp.ppt»
Сл Текст Сл Текст
1Изучение зараженности клещей 19Малеев. Обзор Европейских рекомендаций по
нескольких регионов РФ Borrelia диагностике клещевых бактериальных
burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита инфекций. Клиническая Микробиология и
и патогенными Ehrlichia spp. Флямер Илья Антимикробная Химиотерапия 2005 г. Е. П.
Научный руководитель: М. А. Турчанинова. Шувалова. Инфекционные болезни. Медицина.
ЗАО «НПФ ДНК-Технология» Гимназия на 1990 г. C. Kuyler Doyle, Marcelo B.
Юго-Западе №1543. 2009 год. Labruna, Edward B. Breitschwerdt, Yi-Wei
2Цели: Изучить зараженность клещей Tang, Richard E. Corstvet, Barbara C.
нескольких регионов РФ трансмиссивными Hegarty, Karen C. Bloch, Ping Li, David H.
инфекциями: вирусом клещевого энцефалита Walker, and Jere W. McBride. Detection of
(ВКЭ), B. burgdorferi и патогенными Medically Important Ehrlichia by
Ehrlichia spp. Quantitative Multicolor TaqMan Real-Time
3Задачи: Разработать ПЦР-тест-систему Polymerase Chain Reaction of the dsb Gene.
для выявления патогенных Ehrlichia spp. Journal of Molecular Diagnostics. 2005 г.
Определить с помощью метода ПЦР Olga V. Morozova, Andrey K. Dobrotvorsky,
зараженность клещей ВКЭ, боррелиями и Natalya N. Livanova, Sergey E. Tkachev,
эрлихиями. Проанализировать полученные Valentina N. Bakhvalova, Anatoly B.
данные путем сопоставления с имеющимися в Beklemishev, and Felipe C. Cabello. PCR
литературе данными. Detection of Borrelia burgdorferi Sensu
4Обзор литературы. Клещи. Царство: Lato, Tick-Borne Encephalitis Virus, and
Animalia Тип: Arthropoda Подтип: the Human Granulocytic Ehrlichiosis Agent
Chelicerata Класс: Arachnida Подкласс: in Ixodes persulcatus Ticks from Western
Acari Надотряд: Parasitiformes Отряд: Siberia, Russia. Journal of Clinical
Ixodida Большинство клещей из семейства Microbiology. 2002 г. Hui-Min Feng and
Ixodidae — эктопаразиты, переносящие David H. Walker. Mechanisms of Immunity to
многие заболевания млекопитающих, в Ehrlichia muris: a Model of Monocytotropic
частности, человека. Могут переносить Ehrlichiosis. Infection and immunity. 2004
сразу несколько инфекций. Самые г. Christopher D. Paddock and James E.
распространенные клещи, переносящие Childs. Ehrlichia chaffeensis: a
инфекции: Ixodes persulcatus, I. ricinus, Prototypical Emerging Pathogen. Clinical
I. scapularis, I. pacificus, Dermacentor Microbiology Reviews. 2003 г. И. Н.
variabilis, Amblyomma americanum, Манзенюк, О. Ю. Манзенюк. Клещевые
Rhipicephalus sanguineus. боррелиозы (болезнь Лайма).
5Лайм-боррелиоз. Инфицированность Информационно-методическое пособие. ЗАО
клещей: 8-61%. В среднем, 10-11 тысяч "Вектор-Бест". 2005 г. А. Д.
случаев за год в России (?6,9 случаев на Амосов. Клещевой энцефалит.
100 тысяч человек). Царство: Bacteria Тип: Информационно-методическое пособие. ЗАО
Spirochaetes Класс: Spirochaetes Отряд: "Вектор-Бест". 2006 г. Allen G.
Spirochaetales Семейство: Spirochaetaceae Rodrigo, Paul C. Goracke, Kiarash
Род: Borrelia Вид (комплекс): Borrelia Rowhanian, James I. Mullins. Quantitation
burgdorferi sensu lato. of Target Molecules from Polymerase Chain
6Вирусный клещевой энцефалит. Группа: Rection-Based Limiting Dilutions Assays.
Группа IV ((+)ssRNA) Семейство: AIDS research and human retroviruses. 1997
Flaviviridae Род: Flavivirus Вид: г. Rudenko N, Golovchenko M, Cihl?rova V,
Tick-borne meningoencephalitis virus. Grubhoffer L. Tick-borne encephalitis
Инфицированность клещей: 1-3% (в отдельные virus-specific RT-PCR--a rapid test for
годы - 15-20%). С января по июль detection of the pathogen without viral
зарегистрировано 2264 случая (1,59 случаев RNA purification. Acta Virol. 2004 г. Д.
на 100 тыс. человек) - рост на 35,6% по В. Ребриков, Г. А. Саматов, Д. Ю.
сравнению с 2008 годом. Трофимов, П. А. Семенов, А. М. Савилова,
7Эрлихиоз. Царство: Bacteria Тип: И. А. Кофиади, Д. Д. Абрамов. ПЦР «в
Proteobacteria Класс: Alphaproteobacteria реальном времени». БИНОМ. Лаборатория
Отряд: Rickettsiales Семейство: знаний. 2009 г. Anu J??skel?inen, Xiuqi
Anaplasmataceae Род: Ehrlichia Вид: Han, Matthias Niedrig, Antti Vaheri, and
Ehrlichia chaffeensis, E. muris, E Olli Vapalahti. Diagnosis of Tick-Borne
ewingii, E. canis. Зараженность I. Encephalitis by a ?-Capture Immunoglobulin
рersulcatus E. muris составляет от 1,4 до M-Enzyme Immunoassay Based on Secreted
8,5%. Recombinant Antigen Produced in Insect
8Использованные методики. Экстракция НК Cells. Journal of Clinical Microbiology.
фенольным методом. Реакция обратной 2003 г. Интернет-ресурсы:
транскрипции. Real-time ПЦР. Проверка http://www.infectology.ru/nosology/infecti
чувствительности тест-системы методом us/rikketsiosis/ehrlichioses.aspx
«конечных разведений». Автоматическое http://lib2005.rat-info.ru/files/erlihiozy
секвенирование ДНК по Сэнгеру (методом i_anaplazmozy.pdf
«терминаторов»). Электрофорез ДНК в http://www.molbiol.ru/protocol/13_03.html#
агарозном геле. Подбор последовательностей 2.
праймеров и пробы для real-time ПЦР. 20Схема детекции результатов методом
9Пцр. Суть ПЦР состоит в многократном TaqMan.
избирательном копировании определенного 21Пример графиков накопления продуктов
участка ДНК при помощи ферментов in vitro. амплификации.
Компоненты ПЦР: анализируемый образец ДНК 22Секвенирование ДНК. Секвенирование ДНК
праймеры термостабильная (чаще всего – –определение нуклеотидной
Taq-) полимераза смесь последовательности фрагмента анализируемой
дезоксирибонуклеотидтрифосфатов (дНТФ) ДНК. Ферментативное секвенирование по
буфер. Сэнгеру.
10Принцип метода ПЦР. 23
11Способы детекции результатов ПЦР. 24Исследованный материал Клещи из трех
После проведения реакции («по конечной регионов: Московская область (9 клещей),
точке» - электрофорез, FLASH). Во время Свердловская область (Н. Тагил - 19
реакции («в реальном времени»). Мы клещей), Оренбургская область (84 клещей).
использовали флуоресцентно меченые пробы Клещи из Свердловской области были
типа TaqMan. определены как Ixodes persulcatus.
12Температурный режим: t° Время ПЦР «в 25Экстракция суммарных нуклеиновых
реальном времени» мы проводили на кислот. Гомогенизация клеща в пробирке с
амплификаторе ДТ-322 (ЗАО «НПФ помощью специального пестика. Лизис с
ДНК-Технология»). помощью гуанидина. Выделение
13Написанная тест-система для детекции фенол-хлороформным методом. Хранение при
патогенных Ehrlichia spp. Написана на ген -20°С.
16s rRNA, должна детектировать Ehrlichia 26Проведение реакции обратной
muris, E. chaffensis и E. canis, а также транскрипции (ОТ). Компоненты реакции:
патогенных бактерий близкородственного ОТ-буфер. ОТ-праймеры (случайные или смесь
рода Anaplasma. Длина ПЦР-продукта – 198 случайных и специфических 1:10) Ревертаза
пар нуклеотидов. (обратная транскриптаза) — фермент,
14Результаты и обсуждение. Проверка осуществляющий реакцию. Исследуемая РНК.
чувствительности имевшихся тест-систем. Методика: Инкубирование при 40°С в течение
Проверку делали методом «конечных 30 мин (синтез кДНК) Прогрев при 95°С в
разведений». Патоген. Расчетная течение 5 мин (инактивация фермента).
чувствительность (число стартовых молекул 27Проверка чувствительности тест-системы
ДНК на одну амплификационную пробирку). методом «конечных разведений».
1,54. TBEV. 2,16. B. burgdorferi. Чувствительность тест-системы – параметр,
15Проверка специфичности системы для показывающий, какое число молекул матрицы
детекции Ehrlichia spp. достаточно для положительного срабатывания
16Изучение зараженности клещей B. теста. 1:10 1:2 1:2 1:2 1:2 1:2. К+ к1.
burdorferi, TBEV и Ehrlichia spp. Н. К2. К3. К4. К4. К6.
Тагил. Московская область. Оренбург. B. 28Для статистической обработки
burgdorferi. 1 (6,6%). 0. 10 (11,9%). полученных результатов исползовалась
TBEV. 0. 0. 0. Ehrlichia spp. Не программа Quality (java-версия).
изучалось. 6 (66,6%). 21 (25 %). Всего Чувствительность тест-системы.
клещей: 19. 9. 84. 29Постановка реакции секвенирования. При
17Выводы: Освоены методы: подбор проведении это реакции в реакционной
последовательностей праймеров и проб, пробирке необходимо смешать: Смесь дНТФ,
выделение нуклеиновых кислот фенольным ддНТФ и полимеразы Специальный буфер.
методом экстракции, постановка реакции Праймер Матрица. Температурный режим: 96°С
обратной транскрипции, проведение – 1 мин 96°С – 15 сек 55°С – 10 60°С – 3
real-time ПЦР с «горячим стартом», мин Для проведения электрофореза для
электрофореза ДНК в агарозном геле, секвенирования использовали секвенатор
автоматического секвенирования методом Genetic Analyzer 3130 (Applied
«терминаторов». Разработана тест-система, Biosystems). 25 циклов.
детектирующая патогенных Ehrlichia spp., 30Электрофорез ДНК в агарозном геле.
встречающихся на территории РФ. Получены Электрофорез ДНК — это аналитический
данные о зараженности клещей метод, применяемый для разделения
трансмиссивными инфекциями из нескольких фрагментов ДНК по размеру (длине).
регионов РФ. Полученные нами данные 31Подбор последовательностей
сопоставлены с имеющимися в литературе олигонуклеотидов для детекции Ehrlichia
данными. spp. Для изучения свойств олигонуклеотидов
18Благодарности. Автор выражает мы использовали программу Oligo 6,31.
благодарность коллективу ЗАО «НПФ Последовательности генов мы брали из
ДНК-Технология» за методическую помощь, сервиса GenBank Национального центра
всем участникам Оренбургской биологической биотехнологической информаци, а для поиска
практики гимназии №1543, помогавшим сходных последовательностей нуклеотидов
собирать материал, рецензенту Д. Кнорре за использовали сервис BLAST. Синтез
ценные указания и С. М. Глаголеву за праймеров и проб выполнялся отделом
организацию практики. синтеза олигонуклеотидов ЗАО «НПФ ДНК-
19Литература. Спасибо за внимание! В. В. Технология».
Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp.ppt
http://900igr.net/kartinka/meditsina/izuchenie-zarazhennosti-kleschej-neskolkikh-regionov-rf-borrelia-burgdorferi-virusom-kleschevogo-entsefalita-i-patogennymi-ehrlichia-spp-162474.html
cсылка на страницу

Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp

другие презентации на тему «Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp»

«Вирусы компьютерные» - 1995-1999 год- появление windows-совместимых вирусов. Способы профилактики. Положено начало вирусологии как науки. Выяснить, можно ли получить «прививку» от компьютерных вирусов как, скажем, от биологических? Почему ВИРУС, а не какой-нибудь другой термин? 1974 год Появление первого вируса «Кролик» Rabbit.

«Программа от вирусов» - Что делать, чтобы избежать «заражение»? Системные области компьютера. Компьютерный вирус. Профилактика «заражения» компьютера вирусами. Программы- Детекторы Обнаруживают файлы. Обнаруживают. Антивирусные программы. Признаки, указывающие на поражение программ вирусом. "Лечат" зараженные ресурсы.

«Клещевой энцефалит» - Только при питании кровью возможна жизнь клеща и его размножение. Естественный природный враг клещей – лесные муравьи. Активнее всего клещи весной и летом (в некоторых районах – осенью). Клещи встречаются не в каждом лесу и не на каждом участке леса. Место укуса обработать йодом или спиртом. Выяснение степени влияния клещевого энцефалита на здоровье человека.

«Компьютерные вирусы» - Исчезновение файлов и каталогов. Типы антивирусных программ. Программы – фильтры. Признаки проявления вирусов. Что такое вирус? Подача непредусмотренных звуковых сигналов. Компьютерные вирусы. Вирус способен самопроизвольно присоединяться к другим программам, создавать свои копии… Компьютерный вирус – это специально написанная компьютерная программа.

«Урок Вирусы» - Обсуждение плана работы групп – 1 урок, 20 минут. Признаки, профилактика. Учебные предметы:информатика, биология, анатомия, социология. Игромания. Защита полученных результатов и выводов – 6-й урок. Возникновение, виды, последствия, антивирусы. Подготовка школьниками презентации о проделанной работе – 4-5-й уроки.

«Вирусы на компьютере» - И дело не в стоимости, стране-производителе или размере баз для обновления. Профиль: Основы информатики. Троянский конь (Trojans). Виды вирусов: Виды Антивирусов. Виды антивирусов. Антивирус NOD32. Творческий проект по теме: «Вирусы и антивирусные программы". Антивирус Касперского — антивирусное программное обеспечение, разрабатываемое Лабораторией Касперского.

Вирусы

11 презентаций о вирусах
Урок

Медицина

32 темы
Картинки
900igr.net > Презентации по медицине > Вирусы > Изучение зараженности клещей нескольких регионов РФ Borrelia burgdorferi, вирусом клещевого энцефалита и патогенными Ehrlichia spp