Медицинская помощь
<<  Нпк медицина качество 2014 декабрь Развитие проекта тверского специализированного медицинского бизнес-инкубатора  >>
Зачем радиобиологу изучать сигнальные пути
Зачем радиобиологу изучать сигнальные пути
1,180,980
1,180,980
Пример: Многосайтовый белок GAB1
Пример: Многосайтовый белок GAB1
Пример: Многосайтовый белок GAB1
Пример: Многосайтовый белок GAB1
Состояния комплекса из нескольких рецепторов и адапторов
Состояния комплекса из нескольких рецепторов и адапторов
Доменно-ориентированный подход к сокращению числа переменных
Доменно-ориентированный подход к сокращению числа переменных
Доменно-ориентированный подход к сокращению числа переменных
Доменно-ориентированный подход к сокращению числа переменных
Модуль автоматического доменно-ориентированное сокращения моделей в
Модуль автоматического доменно-ориентированное сокращения моделей в
Сочетанное воздействие инсулином и ЭФР
Сочетанное воздействие инсулином и ЭФР
«Подгонка» параметров системы: сочетанный ЭФР-инсулиновый сигнал
«Подгонка» параметров системы: сочетанный ЭФР-инсулиновый сигнал
Предсказание поведения системы: деплеция GAB1 c помощью миРНК
Предсказание поведения системы: деплеция GAB1 c помощью миРНК
Предсказание поведения системы: ингибирование SHP2
Предсказание поведения системы: ингибирование SHP2
Предсказание поведения системы: ингибирование SHP2
Предсказание поведения системы: ингибирование SHP2
Предсказание поведения системы: деплеция Src
Предсказание поведения системы: деплеция Src
Предсказание поведения системы: деплеция Src
Предсказание поведения системы: деплеция Src
Проблема свободных параметров
Проблема свободных параметров
Проблема свободных параметров
Проблема свободных параметров
Картинки из презентации «Математическая биофизика клетки» к уроку медицины на тему «Медицинская помощь»

Автор: Boris Kholodenko. Чтобы познакомиться с картинкой полного размера, нажмите на её эскиз. Чтобы можно было использовать все картинки для урока медицины, скачайте бесплатно презентацию «Математическая биофизика клетки.ppt» со всеми картинками в zip-архиве размером 4723 КБ.

Математическая биофизика клетки

содержание презентации «Математическая биофизика клетки.ppt»
Сл Текст Сл Текст
1ИЗУЧЕНИЕ МОЛЕКУЛЯРНО-КИНЕТИЧЕСКИХ 9(макро-) описание: 12 переменных и 14
ОСНОВ КАНЦЕРОГЕНЕЗА С ПОМОЩЬЮ реакций. Механистическое (микро-)
ДОМЕННО-ОРИЕНТИРОВАННОГО ПОДХОДА Борисов описание: 18 переменных, 33 реакции.
Н.М. Федеральный медицинский биофизический 10Суть ДОП: замена «полных» (исходных)
центр им. А.И. Бурназяна ФМБА России. белков «вспомогательными» белками, которые
2Международная коллаборация. Thomas имеют меньше сайтов. Полная (микро-)
Jefferson University (Philadelphia, USA): модель. Сокращенная (макро-) модель.
Boris Kholodenko, Anatoly Kiyatkin, Edita 11Модуль автоматического
Aksamitiene, Nikolai Markevich, Jan Hoek, доменно-ориентированное сокращения моделей
Marc Birthwitsle et. al. в среде BioNetGen 2. Borisov et al., IET
Humboldt-University (Berlin, Germany): Systems Biol, 2008.
Stefan Legewie University of Freiburg 12Результат работы
(Germany): Thomas Maiwald University of доменно-ориентированного модуля для
Pittsburgh (USA): Jim Faeder RIKEN BioNetGen 2. Число пермен-ных в микро-/
(JAPAN): Mariko Hatakeyama et al. Институт макро-модели. Число реакций в микро-/
биофизики клетки РАН (Пущино, Россия): макро-модели. Время генерации сигнального
Н.П.Каймачников, М.Цыганов ФМБЦ им. пути, сек, для микро-/ макро-модели. Время
А.И.Бурназяна (Москва, Россия): интеграции системы ОДУ, сек, для микро-/
Н.М.Борисов, А.С.Чистопольский и др. макро-модели. Egfr-подобный димер.
3Зачем радиобиологу изучать сигнальные Egfr-подобный димер. Рецептор с 2
пути? Судьба клетки определяется временн?й тирозиновыми сайтами. 708/108. 7432/534.
зависимостью активации белка-эффектора. 51.6/8.45. 1.45/0.22. Рецептор с 2
Marshall, 1995: Временная зависимость тирозиновыми сайтами. 6000/135. 81364/642.
активации ERK определяет судьбу клетки. 662.0/12.0. 12.58/0.76. Fc?ri-подобный
Быстро убывающий сигнал приводит к димер. Fc?ri-подобный димер. Рецептор с 2
пролиферации с риском злокачественных тирозиновыми сайтами. 213/48. 2230/198.
трансформаций, а продолжительный сигнал 14.2/3.87. 0.47/0.15. Рецептор с 2
способен инициировать экспрессию генов, тирозиновыми сайтами. 1599/60. 22990/240.
отвечающих за дифференцировку клеток. 182.4/6.02. 3.58/0.12.
Дифференцировка. Пролиферация. Клетка. 13Сочетанное воздействие инсулином и
Апоптоз. ЭФР. Borisov et al, 2009, Mol Syst Biol,
41,180,980. Проблема комбинаторной 2009 (submitted).
сложности при математическом моделировании 14Сравнение «независимого» и
сигнальных путей. Сайт. Состояние. L. «конкурентного» подход в больших моделях.
Пример: ErbB-рецепторы. Ligand Binding. Модель. Сигнальный путь ЭФР: независимая
Bound or Not. 1. 2. Dimer-ization. None or модель с ДОП, Kiyatkin et al, JBC, 2006.
1,2,3,4. 1. 5. Kinase Domain. Active or Сочетанный путь ЭФР-инсулин: конкурентная
Inactive. 2. 1. Yarden and Sliwkowski, модель, Borisov et al, MSB, 2009
Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 2:127 (2001). (submitted). Число переменных. Около 200.
Docking (pY). Y, pY, Bound. 3. 10. У 78. Число реакций. Около 500. 111.
сигнальных белков имеется множество сайтов 15«Подгонка» параметров системы:
связывания, каждый из которых может быть в сочетанный ЭФР-инсулиновый сигнал.
множестве состояний Каждой комбинации 16Предсказание поведения системы:
состояний сайтов соответствует переменная деплеция GAB1 c помощью миРНК.
в системе ОДУ. 21*51*21*310=. Число 17Предсказание поведения системы:
переменных: p. Y. Y. Y. Y. A1. p. Y. Y. p. ингибирование SHP2.
A2. Y. Y. p. p. Y. Y. 18Предсказание поведения системы:
5Пример: Многосайтовый белок GAB1. PH: деплеция Src.
Pleckstrin Homology MBS: Met Binding 19Философский вопрос: нужны ли большие
Sequence P: Proline Rich Domains GBS: Grb2 модели в биологии. 1. Вычислительная
Binding Sequence. Schaeper et al., J. Cell математика «выросла» из «прямых» задач
Biol., 2000. (таких, как задача Коши и др.), для
6Состояния комплекса из нескольких решения которых «законы природы» были
рецепторов и адапторов. известны и просты (законы Ньютона в
7Bionetgen 2, среда для физике, закон действующих масс в химии).
программирования кинетических систем (jim 2. В биологии «законы природы» сложнее и
faeder, upitt). Step2: Network generation не всегда известны, поэтому для их
(net-file). Step3: ODE solving. Step 1: исследования почти всегда приходится
Model specification (BNGL-file). решать «обратные» зачади вычислительной
Parameters. Parameters. Blocks: Blocks: математики.
Species (list of all species ). Species 20Проблема свободных параметров. 4.
(seed). Reactions. Reaction rules. Groups Астрономия началась с неверной гипотезы о
(species and their weights for each «законах природы» (геоцентризм). Она, тем
observable). Observables (patterns). не менее, укладывалась в тогдашние
8Два предельных случая. Абсолютно наблюдения. 5. К эпохе Возрождения
конкурентное связывание партнеров на возникла проблема несоответствия
многоцентровых белках. Удобно для наблюдаемых данных и птолемеевского
моделирования: нет комбинаторной сложности геоцентризма. 6. В эпоху Возрождения было
Абсолютно независимое связывание партнеров предложено два подхода к астрономии –
на многоцентровых белках. Необходимы пересмотр парадигмы
методы уменьшения числа переменных! (Коперник-Кеплер-Ньютон) и подгонак
Промежуточный случай – наличие свобюодных параметров под геоцентризм
аллостерических взаимодействий между (Тихо Браге.
партнерами (с точки зрения моделирования 21Проблема свободных параметров. 7.
самый неудобный): основной метод – Любую математическую модель можно
ограничение числа молекул в комплексе. «втиснуть» в совокупность
9Доменно-ориентированный подход к экспериментальных данных за счет свободных
сокращению числа переменных. Borisov et параметров, но ценность такой модели
al., Biophys J, 2005; biosystems, 2006: S сомнительна. 8. Значит, ценная
– многосайтовый адаптор, R – рецепторная математическая модель должна давать
тирозин-киназа, A1 and A2 – партнеры белка нетривиальные экспериментально проверяемые
S. Если связывание A1 and A2 происходит предсказания после подгонки свободных
независимо, то: Доменно-ориентированное параметров.
Математическая биофизика клетки.ppt
http://900igr.net/kartinka/meditsina/matematicheskaja-biofizika-kletki-251013.html
cсылка на страницу

Математическая биофизика клетки

другие презентации на тему «Математическая биофизика клетки»

«Молекулярно-кинетическая теория» - Молекулярная физика. Электронный микроскоп. Ионный проектор. Основные понятия МКТ. Химический элемент- совокупность атомов одного вида. Основные положения молекулярно-кинетической теории. Частицы вещества взаимодействуют друг с другом. Доказательства первого положения МКТ. Доказательства третьего положения МКТ.

«Объектно-ориентированное программирование» - Зарплата 1. Концепция. 2. Что такое методы класса? Предпосылки и история. Уделяем внимание лишь важным аспектам Пример : преподаватель - студент. Содержание. Реализация методов класса. Вопрос 3. Описание класса в Delphi. Зарплата. 2. Что такое полиморфизм? Рост сложности программ. Этапы развития программирования.

«Личностно-ориентированное обучение» - Развитие познавательных сил. Способы усвоения и процессы мышления. Развитие творческих способностей. Целью российского образования в настоящее время. Усвоение знаний. Функции педагога: Какие задания можно использовать. Педагогические технологии на основе личностно-ориентированного подхода. Задача школы.

«Молекулярная биология» - Промотор имеет 2 консервативные последовательности: 1)бокс Прибнова или -10 последовательность. Цистронная организация гена. Ген отвечает за развитие конкретного признака (один ген – один признак). Тема: Молекулярная биология гена. Ген. Исследования на фагах кишечной палочке сальмонелле грибках. Регуляторные последовательности, функции.

«Медицинская помощь при травмах» - Профилактика травм опорно-двигательного аппарата. Оказание первой медицинской помощи при переломе костей таза. Поддерживайте проходимость дыхательных путей. Наложить на поврежденное место тугую повязку. На рану в области перелома наложить стерильную повязку. Доставить пострадавшего в медицинское учреждение.

«Первая медицинская помощь» - Первая помощь при ранениях мягких тканей головы. Виды ран. Повязки при переломах. Бывают поверхностные и глубокие. Колотые Резаные Рубленые Ушибленные Огнестрельные. Частичная противохимическая обработка и введение антибиотиков, противостолбнячной сыворотки. При шоке и большой кровопотере производится струйное переливание крови.

Медицинская помощь

14 презентаций о медицинской помощи
Урок

Медицина

32 темы
Картинки
900igr.net > Презентации по медицине > Медицинская помощь > Математическая биофизика клетки